欧阳乐 副教授

  • 办公室:N802
  • 导师类别:博士生导师
  • E-mail:leouyang(AT) szu.edu.cn
  • 办公电话:0755-26659561
个人详情

个人简介

欧阳乐副教授,特聘研究员,博士生导师。IEEE会员CCF高级会员。20156月获中山大学理学博士学位;2013-2014年,赴新加坡南洋理工大学计算机科学系交流访问。2015-2016年在香港城市大学电子工程系从事博士后研究。主要从事机器学习、数据挖掘和生物信息学等领域的科研和教学工作。广东省自然科学基金杰出青年项目、广东省珠江人才计划青年拔尖人才、深圳市优秀青年基金、深圳大学“荔园优青”获得者。主持国家级项目2项、省级项目3项,已在Nature BiotechnologyIEEE TCYBBioinformaticsBriefings in BioinformaticsPattern RecognitionIEEE JbHIIEEE/ACM TCBB等高水平期刊发表SCI论文70余篇,获授权发明专利5项。担任Nature CommunicationsNucleic Acids ResearchGenome BiologyAdvanced ScienceIEEE TPAMIIEEE TNNLSBioinformaticsPLoS Computational BiologyBriefings in Bioinformatics等重要刊物审稿人,AAAIIJCAIICMLNIPSICLR等国际学术会议程序委员会委员。

研究兴趣

机器学习、数据挖掘和医学大数据

研究内容

基于机器学习方法的生物医学大数据挖掘、多源异构数据融合分析、图神经网络、概率图模型、矩阵分解模型

教授课程

复变函数、机器学习(文华班)

研究生招生方向

学术型博士:信息与通信工程

专业型博士:新一代电子信息技术

学术型硕士:信息与通信工程

专业型硕士:新一代电子信息技术

学术服务

中国计算机学会生物信息学专业委员会委员

中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会委员

中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员

广东省生物信息学会理事

Frontiers in Genetics编委、客座编辑

ICMLIJCAIAAAINIPSICLRIEEE BIBM程序委员会委员

近五年主持科研项目清单

1. 国家自然科学基金面上项目,2022.01-2025.12

2. 国家自然科学基金青年基金项目,2017.01-2019.12

3. 广东省自然科学基金面上项目,2019.10-2022.09

4. 广东省自然科学基金面上项目,2022.01-2024.12

5. 广东省自然科学基金杰出青年项目,2024.01-2026.12

6. 广东省教育厅重点领域专项,2023.01-2025.12

7. 深圳市优秀青年基金项目,2023.04-2026.03

8. 深圳市基础研究面上项目,2023.11-2026.10

9. 深圳市科技计划基础研究项目,2018.03-2020.03

10. 深圳市高端人才科研启动项目,2019.01-2021.12

期刊论文

[1] Youlin Zhan, Jiahan Liu, Le Ou-Yang*, scMIC: A Deep Multi-Level Information Fusion Framework for Clustering Single-Cell Multi-Omics Data, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 27(12): 6121-6132, 2023.

[2] Zerun Lin, Le Ou-Yang*, Inferring gene regulatory networks from single-cell gene expression data via deep multi-view contrastive learning, Briefings in Bioinformatics, 24(1): bbac586, 2023.

[3] Youlin Zhan, Jiahan Liu, Min Wu, Chris Soon Heng Tan, Xiaoli Li, Le Ou-Yang*, A partially shared joint clustering framework for detecting protein complexes from multiple state-specific signed interaction networks, Computers in Biology and Medicine, 159: 106936, 2023.

[4] Le Ou-Yang, Fan Lu, Zi-Chao Zhang, Min Wu, Matrix factorization for biomedical link prediction and scRNA-seq data imputation: an empirical survey, Briefings in Bioinformatics, 2022, 23(1): bbab479.

[5] Guanhua Zou, Yilong Lin, Tianyang Han, Le Ou-Yang*, DEMOC: a deep embedded multi-omics learning approach for clustering single-cell CITE-seq data, Briefings in Bioinformatics, 2022, 23(5): bbac347.

[6] Wenhui Wu, Yujie Chen, Ran Wang, Le Ou-Yang*, Self-representative kernel concept factorization, Knowledge-Based Systems, 2023, 259: 110051.

[7] Le Ou-Yang, Dehan Cai, Xiao-Fei Zhang, Hong Yan, WDNE: an integrative graphical model for inferring differential networks from multi-platform gene expression data with missing values, Briefings in Bioinformatics, 2021, 22(6): bbab086.

[8] Le Ou-Yang, Xiao-Fei Zhang, Hong Yan, Sparse regularized low-rank tensor regression with applications in genomic data analysis. Pattern Recognition, 2020, 107: 107516.

[9] Xiao-Fei Zhang, Le Ou-Yang*, Ting Yan, Xiaohua Hu, Hong Yan, A joint graphical model for inferring gene networks across multiple subpopulations and data types, IEEE Transactions on Cybernetics, 2021, 51(2): 1043-1055.

[10] Zi-Chao Zhang, Xiao-Fei Zhang, Min Wu, Le Ou-Yang*, Xing-Ming Zhao, Xiao-Li Li, A Graph Regularized Generalized Matrix Factorization Model for Predicting Links in Biomedical Bipartite Networks, Bioinformatics, 2020, 36(11): 3474-3481.

[11] Le Ou-Yang, Xiao-Fei Zhang*, Xiaohua Hu, Hong Yan, Differential network analysis via weighted fused conditional Gaussian graphical model, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2020, 17(6): 2162 - 2169

[12] Xiao-Fei Zhang, Le Ou-Yang*, Shuo Yang, Xing-Ming Zhao, Xiaohua Hu, Hong Yan, EnImpute: imputing dropout events in single cell RNA sequencing data via ensemble learning, Bioinformatics, 2019, 35(22): 4827-4829.

[13] Xiao-Fei Zhang, Le Ou-Yang*, Shuo Yang, Xiaohua Hu, Hong Yan, DiffNetFDR: Differential network analysis with false discovery rate control, Bioinformatics, 2019,35(17): 3184-3186.

[14] Le Ou-Yang, Xiao-Fei Zhang, Xing-Ming Zhao, Debby D Wang, Fu Lee Wang, Baiying Lei, Hong Yan, Joint Learning of Multiple Differential Networks With Latent Variables, IEEE Transactions on Cybernetics, 2019, 49(9): 3494-3506.

[15] Jiang Huang, Min Wu, Fan Lu, Le Ou-Yang*, Zexuan Zhu, Predicting synthetic lethal interactions in human cancers using graph regularized self-representative matrix factorization, BMC Bioinformatics,2019, 20(19): 657.

[16] Yuanxiao Chen, Xiao-Fei Zhang, Le Ou-Yang*, Inferring cancer common and specific gene networks via multi-layer joint graphical model, Computational and Structural Biotechnology Journal, 2023, 21: 974-990.

[17] Zerun Lin, Yuhan Zhang, Lixin Duan, Le Ou-Yang*, Peilin Zhao*, MoVAE: A Variational AutoEncoder for Molecular Graph Generation, Proceedings of the 2023 SIAM International Conference on Data Mining (SDM), 2023: 514-522.

[18] Xiao-Fei Zhang, Le Ou-Yang*, Shuo Yang, Xiaohua Hu, Hong Yan,, DiffGraph: An R package for identifying gene network rewiring using differential graphical models, Bioinformatics, 34.9 (2018): 1571-1573.

获奖信息

2011年获中山大学优秀研究生

2013年获博士研究生国家奖学金

2017年获深圳市海外高层次人才(孔雀计划)C

2018年获南山区“领航人才”C

2018年获广东省珠江人才计划青年拔尖人才

2020年获深圳大学优秀青年教师

2021年获深圳大学新锐研究生导师

2022年获腾讯益友奖“优秀班主任”

2022年获广东省大学生创新创业训练计划优秀指导教师

2023年获广东省大学生计算机设计大赛优秀指导教师

指导学生获奖情况

指导学生获得美国大学生数学建模竞赛一等奖3

指导学生获得美国大学生数学建模竞赛二等奖5

指导学生获得中国大学生计算机设计大赛二等奖4项、三等奖1

指导学生获得2021年中国大学生计算机设计大赛一等奖1

指导学生获得2019mathorcup高校数学建模挑战赛二等奖1

指导国家级大学生创新创业训练计划3

指导省级大学生创新创业训练计划4

指导学生获得首届兴智杯全国人工智能创新应用大赛三等奖1

指导学生获得首届兴智杯全国人工智能创新应用大赛行业赋能专题赛一等奖1

指导学生获得中国电子学会2023首届大学生算法大赛三等奖2

研究生招生

招收有志于从事科学研究的学生(学术型和专业型均可)

要求:

a) 高等数学、线性代数、数值分析、概率论与数理统计等课程基础扎实;

b) 至少精通两门编程语言:MatlabPythonC++Java;

c) 英语的听说读写能力强,有较强的英文阅读和写作能力,一般要求英语六级500分以上;

d) 对研究方向感兴趣,对科学研究有热情,不怕吃苦、不怕失败、做事认真负责。混学位者请勿联系。

注:从事科学研究并不指毕业后只是在高校和研究所工作,也指愿意毕业后去著名公司从事研发工作或研究院工作、或出国留学继续攻读博士学位等。

本科生招生

招收有志于在深圳大学攻读硕士研究生或有志于在本科/硕士阶段后攻读国外大学硕士/博士学位的1-3年级本科生。

要求:有志于在未来从事数据挖掘、机器学习方向学术研究的学生,尤其侧重于生物医学数据分析和机器学习算法研究。要求数学和编程相关课程学业成绩较高。能够把课余的5070%的时间全部用于科研中,只有集中精力做好一件事才能做好。

修读或自修以下课程:线性代数、概率统计、Matlab/Python、多元统计分析、矩阵论。

毕业生去向

2021届硕士:卢帆(中国电信)、吴永贤(交通银行)

2022届硕士:林明雄(腾讯)、林奕龙(华为)

2023届硕士:林泽润(OPPO)、刘家瀚(瑞德林生物技术有限公司)、

                        邹观华、陈媛晓(比亚迪)

在读硕士

2021级:易毅强(腾讯实习)、詹游麟(腾讯实习)、万旭(腾讯实习)、陈雨洁

2022级:周嘉好、陈付群、黄子博、翁忻锐

2023级:蔡广场、温柯沛、赵辉、余伟明、罗浠灵

指导博士

2023级:栗莹(优博)

指导本科生

2019届:张子超(保送复旦大学直博)、林明雄(保研深大)

2020届:蔡德涵(香港城市大学直博)、梁浩(保研厦大)、王璟(保研西电)、邱钰茹(澳门大学读研)

2022届:周嘉好(保研深大)、周润东(华为)

2024届:董东沛(保研华南理工)